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1999
Em 1999 ocorre a implantação gradativa do Ensino Médio, da LDB 9394/96, com alteração no calendário escolar para 200 dias, sistema de avaliação semestral e sistema opcional de modalidades esportivas para a prática das aulas curriculares de Educação Física. Ainda em 1999 é criado o Software Educacional - EDUCEP - ENERGIA pelos professores de Biologia, Física, Química e Informática do Colégio Estadual do Paraná.
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2000
O ano de 2000 foi marcado pelas Comemorações dos 500 anos do Descobrimento do Brasil e no dia 29 de março deste ano é inaugurada a "Galeria de Diretores", em comemoração aos 50 anos de inauguração da atual sede do Colégio.
Foram diretores do Colégio Estadual do Paraná de 1950 - 2000
- Adriano Gustavo Carlos Robine (1946/1951)
- Francisco José Gomes Ribeiro (1939/1946 - 1951/1956)
- Ulisses de Mello e Silva (1956/1961)
- Eurico Back (1961/1962)
- Eros Nascimento Gradowski (1962/1966)
- Ernani Costa Straube (1966/1969)
- Osny Antonio Dacol (1969/1983)
- Eraldo Mário Graeml (1983/1986)
- Diva Vidal (1986/1987)
- Ayrton Gonçalves Celestino (1987/1990)
- Paulo Osni Wendt (1990/1991)
- Adelia Dias Castelã Ribeiro (1991/2002)
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2001
No ano de 2001 foi solicitada a cessação definitiva dos cursos profissionalizantes amparados pela LDB 5692/71. Através da Resolução nº 3160/2001, é autorizado o funcionamento dos cursos de Educação Profissional de Nível Técnico, aprovados pela PARANATEC.
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2002
A partir de julho de 2002 a nomenclatura do Estabelecimento volta a ser Colégio Estadual do Paraná - Ensino Médio e Profissional, pela Resolução nº3.160/2001. Autorização e Reconhecimento dos cursos Pós Médio: Técnico em Hospitalidade (Resolução nº174, de 23 de janeiro), Técnico em Secretariado (Resolução nº465, de 18 de fevereiro), Técnico em Informática (Resolução nº173, de 23 janeiro).
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2003
Em 2003 ocorre a renovação de Reconhecimento do Ensino Médio e Profissional pela Resolução nº3.415, Diário Oficial nº6.619, de 3 de dezembro. É feita a aprovação da Proposta Curricular para implantação de Cursos de Educação Profissional Nível Técnico, integrado ao Ensio Médio (04 anos), Parecer nº109503, de 18 de dezembro, do Conselho Estadual de Educação.
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2004
No ano de 2004 inicia de forma gradativa a implantação dos Cursos de Comunicação e Artes e de Edificações no período noturno.
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2005
No ano de 2005, foi implantada a trimestralidade no sistema de avaliação. Inicia, na modalidade subseqüente, o curso de Administração. Em fevereiro, é aprovado o Novo Regimento Escolar. Eleito o novo Conselho Escolar, de acordo com o Novo Estatuto, normatizado pela SEED.
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2006
Em 2006, em comemoração aos 160 anos do CEP, acontece a reestruturação das piscinas.